به گزارش میز نفت، با دستور میرکاظمی در سال 1388 از یک کارشناس ساده در برنامه ریزی تلفیقی شرکت ملی نفت، به معاون برنامه ریزی وزارت نفت منصوب شد.
تا پایان دولت دوم محمود احمدینژاد عهده دار این سمت بود اما در دوره روحانی، جای خود را به منصور معظمی داد.او در معاونت برنامه ریزی باقی ماند اما در سال 98 به ستاد اجرایی فرمان امام رفت؛ جایی که همشهری او یعنی محمد مخبر دزفولی رئیسش بود.
محسن خجسته مهر مدیرعامل شرکت حفاری تدبیر شد که عملکرد انتقاد برانگیزی از خود به جای گذاشت.در سال 1400 و پس از انتخابات بود که جواد اوجی برای او حکم مدیریت شرکت ملی نفت را صادر کرد.
حاشیه او با این سمت آغاز شد؛ ابتدا موضوع دریافت حقوق او از ستاد اجرایی و شرکت ملی نفت تبدیل به یک رسوایی شد.
سپس موضوع مهاجرت فرزندش به آمریکا که با ورود رئیس جمهور، او را در یکقدمی برکناری قرار داد.اختلافات خجسته مهر با وزیر نفت بیشتر شد بهطوریکه جواد اوجی، در برخی انتصابهای نفتی بهجای او عزل و نصب کرد.
حواشی مدیرعامل نفت برای وزیر نفت، بهقدری چالشبرانگیز شد که تبعات بدی در دولت برای او ایجاد کرد.خجسته مهر را گزینه وزارت نفت در دولت بعد میدانستند اما با درگذشت ابراهیم رئیسی، همهچیز بر باد رفت
.